Programme

La peptidomique, une même démarche pour répondre à différentes questionsProgramme prévisionnel

Lundi 29/11

• 17h - 17h30 : Présentation de l'école et du réseau MassProt'INRAE
• 17h30 - 18h : Tour de table des participants - Questions et attentes

Mardi 30/11

• 8h30 - 10h : Introduction à la protéomique (M. Blein-Nicolas)
• 10h30 - 12h30 : Préparation des extraits protéiques (A.-P. Teixeira)

• 12h30 - 14h : Pause déjeuner

• 14h - 16h : Bioséparation et préparation d'échantillons particuliers (T. Rabilloud, titre à venir)
• 16h30 - 17h30 : Principes de la spectrométrie de masse (A. Seassau)
• 17h30 - 18h : Discussion générale autour des plans d'expérience

Mercredi 01/12

• 9h - 10h : Stratégies classiques d'identification par protéomique Bottom-up (V. Labas)
• 10h30 - 12h : TD identification classique avec le logiciel X!TandemPipeline (T. Balliau)

• 12h - 14h : Pause déjeuner

• 14h - 15h : Analyse des modifications post-traductionnelles (S. Hem)
• 15h15 - 16h15 : TD identification de protéines modifiées avec le logiciel X!TandemPipeline (T. Balliau)
• 16h30 - 17h30 : Séminaire protéomique animale (C. Pineau, titre à venir)

Jeudi 02/12

• 8h30 - 10h30 : Méthodes quantitative (S. Hem)
• 11h - 12h : Approches "Data independent" (C. Guerrera)

• 12h- 14h : Pause déjeuner

• 14h - 15h : Analyse des données de protéomique  (M. Blein-Nicolas)
• 15h15 - 16h45 : Outils d'analyse fonctionnelle (M. Le Gall)
• 17h - 18h : Imagerie moléculaire, profiling maldi et machine learning associé (V. Labas)

Vendredi 03/12

• 8h30 - 9h30 : La peptidomique, une même démarche pour répondre à différentes questions (V. Julliard)
• 9h30 - 10h30 : Protéomique Top-Down: promesses et défis (C. Henry)
• 11h - 12h : Table ronde "Utiliser et publier les données de protéomique: (bon.ne.s) questions, pratiques et usages"